Here is a list of all functions, variables, defines, enums, and typedefs with links to the files they belong to:

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• LeafIndexToNodeIndex() : muscle_tree.c , muscle_tree.h
• LEFT_NODE : tree.h
• LINKAGE_AVG : muscle_upgma.h
• LINKAGE_BIASED : muscle_upgma.h
• linkage_e : muscle_upgma.h
• LINKAGE_MAX : muscle_upgma.h
• LINKAGE_MIN : muscle_upgma.h
• LINKAGE_NEIGHBORJOINING : muscle_upgma.h
• linkage_t : muscle_upgma.h
• LIST_APPEND : list.h
• LIST_DATA : list.h
• list_elem_t : list.h
• LIST_IS_HEAD : list.h
• LIST_IS_TAIL : list.h
• LIST_NEXT : list.h
• LIST_PREPEND : list.h
• LIST_SIZE : list.h
• LIST_TAIL : list.h
• ListDestroy() : list.c , list.h
• ListInit() : list.c , list.h
• ListInsertNext() : list.c , list.h
• ListRemoveNext() : list.c , list.h
• Log() : log.c , log.h
• log2 : mbed.c
• LOG_CRITICAL : log.h
• LOG_DEBUG : log.h
• LOG_ERROR : log.h
• LOG_FATAL : log.h
• LOG_FORCED_DEBUG : log.h
• LOG_INFO : log.h
• LOG_NUM_LEVELS : log.h
• LOG_VERBOSE : log.h
• LOG_WARN : log.h
• LogCritical() : log.c
• LogDefaultSetup() : log.c , log.h
• LogError() : log.c
• LogFatal() : log.c
• LogForcedDebug() : log.c
• LogFuncOverwrite() : log.h , log.c
• LogGetFP() : log.c , log.h
• LOGLEVEL_THRESHOLD : progress.c
• LogMute() : log.h , log.c
• LogMuteAll() : log.c , log.h
• LogSetFP() : log.c , log.h
• LogSetFPForAll() : log.c , log.h
• LogSqInfo() : seq.c , seq.h
• LogTree() : muscle_tree.h , muscle_tree.c
• LogVfprintf() : log.c
• LogWarn() : log.c